Evaluation of Bayesian methods of genomic association via chromosomic regions using simulated data

نویسندگان

چکیده

The development of efficient methods for genome–wide association studies (GWAS) between quantitative trait loci (QTL) and genetic values is extremely important to animal plant breeding programs. Bayesian approaches that aim select regions single nucleotide polymorphisms (SNPs) proved be efficient, indicating genes with effects. Among the selection criteria SNPs or regions, criterion by percentage variance can explained genomic (%var), tag SNPs, based on window posterior probability (WPPA). To also detect potentially associated we proposed measuring interval PPint), which aims markers greatest Therefore, objective this work was evaluate these approaches, in terms efficiency selecting identifying located within close traits. This study aimed compare methodologies single–marker analyses. accomplish this, simulated data were used six scenarios, allocated non–overlapping regions. Considering traits oligogenic inheritance, WPPA followed %var PPint shown superior, presenting higher detection power, capturing percentages larger areas. For polygenic considered superior. Single–marker analyses identified only inheritance scenarios lower than other criteria.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

The Impact of Different Genetic Architectures on Accuracy of Genomic Selection Using Three Bayesian Methods

Genome-wide evaluation uses the associations of a large number of single nucleotide polymorphism (SNP) markers across the whole genome and then combines the statistical methods with genomic data to predict the genetic values. Genomic predictions relieson linkage disequilibrium (LD) between genetic markers and quantitative trait loci (QTL) in a population. Methods that use all markers simultaneo...

متن کامل

hazard evaluation of gas condensate stabilization and dehydration unit of parsian gas refinery using hazop procedures

شناسایی مخاطرات در واحد 400 پالایشگاه گاز پارسیان. در این پروزه با بکارگیری از تکنیک hazop به شناسا یی مخاطرات ، انحرافات ممکن و در صورت لزوم ارایه راهکارهای مناسب جهت افزایش ایمنی فرا یند پرداخته میگردد. شرایط عملیاتی مخاطره آمیز نظیر فشار و دمای بالا و وجود ترکیبات مختلف سمی و قابل انفجار در واحدهای پالایش گاز، ضرورت توجه به موارد ایمنی در این چنین واحدهایی را مشخص می سازد. مطالعه hazop یک ر...

development of different optical methods for determination of glucose using cadmium telluride quantum dots and silver nanoparticles

a simple, rapid and low-cost scanner spectroscopy method for the glucose determination by utilizing glucose oxidase and cdte/tga quantum dots as chromoionophore has been described. the detection was based on the combination of the glucose enzymatic reaction and the quenching effect of h2o2 on the cdte quantum dots (qds) photoluminescence.in this study glucose was determined by utilizing glucose...

comparative dna interaction studies of antiviral drug, zidovudine and its complex using different instrumental methods

هدف از این مطالعه بررسی امکان استفاده از داروهای شناخته شده در درمان سایر بیماریها به عنوان داروهای ضد سرطان است. همچنین با استفاده از این داروها در ساختمان کمپلکس فلز می توان شاخص های دارویی بدست آمده را بررسی نمود. داروی ضد ویروس ایدز(hiv)به نام زیدوودین(azt)انتخاب و.کمپلکس.محلول.در.آب[pt(azt)2]cl2سنتزو به روشهای مختلف فیزیکی و شیمیایی شناسایی گردید. بر هم کنش مقایسه ای این دارو و کمپلکس پلا...

15 صفحه اول

data mining rules and classification methods in insurance: the case of collision insurance

assigning premium to the insurance contract in iran mostly has based on some old rules have been authorized by government, in such a situation predicting premium by analyzing database and it’s characteristics will be definitely such a big mistake. therefore the most beneficial information one can gathered from these data is the amount of loss happens during one contract to predicting insurance ...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Scientia Agricola

سال: 2022

ISSN: ['1678-992X', '0103-9016']

DOI: https://doi.org/10.1590/1678-992x-2020-0202